Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nubp2Q9R061 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nubp2Q9R061 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms