Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmfrQ9R049 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms