Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf4Q9QZS2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms