Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan3Q9QY33 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms