Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxe3Q9QY14 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms