Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms