Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcsk1nQ9QXV0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms