Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms