Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChmQ9QXG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms