Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms