Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-OaQ9QWV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-OaQ9QWV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms