Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rai2Q9QVY8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms