Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mid2Q9QUS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mid2Q9QUS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms