Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma6Q9QUM9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms