Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msh5Q9QUM7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msh5Q9QUM7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msh5Q9QUM7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms