Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain4Q9JMG4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkain4Q9JMG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain4Q9JMG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms