Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms