Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn6Q9JMB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn6Q9JMB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms