Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg4Q9JM99 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prg4Q9JM99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prg4Q9JM99 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prg4Q9JM99 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prg4Q9JM99 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prg4Q9JM99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms