Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep4Q9JM96 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms