Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Reep6Q9JM62 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep6Q9JM62 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep6Q9JM62 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms