Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf19Q9JLL3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms