Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp1Q9JLK7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms