Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TefQ9JLC6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TefQ9JLC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms