Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot9Q9JKY0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms