Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldb3Q9JKS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms