Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx6Q9JKK1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms