Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nectin1Q9JKF6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nectin1Q9JKF6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms