Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem3Q9JKE1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms