Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msgn1Q9JK54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms