Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms