Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms