Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms