Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml1Q9JIZ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms