Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1fQ9JIS7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms