Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tulp4Q9JIL5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp4Q9JIL5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp4Q9JIL5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms