Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus3Q9JI38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms