Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms