Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rb1cc1Q9ESK9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rb1cc1Q9ESK9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms