Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem27Q9ESG4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms