Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rtn3Q9ES97 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Rtn3Q9ES97 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Rtn3Q9ES97 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Rtn3Q9ES97 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Rtn3Q9ES97 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rtn3Q9ES97 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms