Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ush1cQ9ES64 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms