Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp29Q9ES63 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms