Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERQ3

Znf704, Zinc finger protein 704, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf704Q9ERQ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf704Q9ERQ3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf704Q9ERQ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf704Q9ERQ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms