Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tfip11Q9ERA6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms