Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms