Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ndst4Q9EQW8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ndst4Q9EQW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Ndst4Q9EQW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ndst4Q9EQW8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ndst4Q9EQW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ndst4Q9EQW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ndst4Q9EQW8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndst4Q9EQW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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