Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms