Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap1Q9EPJ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap1Q9EPJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms