Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a1Q9EPE9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms